Sysmex Mag Octobre 2022 www.sysmex.fr

Retour sommaire Contrôle microbiologique des vins par cytométrie en flux La cytométrie en flux (CMF) appliquée aux contrôles microbiologiques du vin est de plus en plus déployée dans les laboratoires de contrôle microbiologique. Cette technologie est depuis longtemps utilisée en industries agroalimentaires et pharmaceutiques, notamment pour le suivi des processus de fermentation (bière, vin, cidre, pro- duits laitiers fermentés, jus de fruits…). La CMF permet d’obtenir un dénombrement très précis des populations microbiennes présentes dans l’échantillon, mais elle complète également ce dénombrement par une caractérisation de l’activité métabolique des microorganismes. L’analyse par CMF permet de distinguer en pre- mière intention les particules présentes dans un échantillon liquide en fonction de deux paramètres physiques; la taille et la granulosité (para- mètres : FSC-forward scatter et SSC-side scatter) qui permettent de distinguer les bactéries des levures dans un mélange. Elle permet également d’identifier les populations microbiennes mortes ou vivantes par l’analyse de la viabilité cellulaire. La cytométrie en flux s’appuie sur un double marquage fluorescent qui permet de mettre en évidence les cellules intègres (dites vivantes) et les cellules dont la membrane est altérée (mortes) via plusieurs familles de mar- queurs : les marqueurs d’ADN, et les marqueurs d’activité estérasique. Fig 1 : Histogramme taille (FSC) en fonction de granulosité (SSC Fig 2 : Histogramme bi-para- métrique FL1 (Syto-Vert) / FL3 (IP-rouge) - fenêtrage sur les populations présentes dans l’échantillon (vivantes, mortes et intermédiaires) Dans le cadre d’une analyse microbiologique dans le vin, le dénombrement des microorganismes est très utile pour un examen rapide des processus de fermentation ou pour apprécier la charge en contaminants. Lors d’une recherche de levures brettanomyces, levures affectants le gout et l’odeur du vin, l’infor- mation importante est la quantité de cellules actives qui présentent un danger pour le vin. La recherche systématique de levures mortes et vivantes présente dans ce cas peu d’intérêt. Le résultat pertinent qui va orienter la décision de l’œnologue est le comptage des brettanomyces susceptibles de dégrader les arômes positifs. Il est donc important de pratiquer une analyse très spécifique des brettanomyces vivantes ou en tous cas actives dans l’échantillon au moment de la prise d’essais en barrique ou en fûts. Pour le suivi d’activité fermentaire, il sera plu- tôt utile d’observer la viabilité cellulaire et donc d’apprécier l’état physiologique des levures ou des bactéries en pratiquant une exploration de l’activité estérasique par marquage simple avec une sonde FDA/cFDA. Si nécessaire, une analyse bi para- métrique du type Sysmex/BacCount viables est également possible. Le résultat de cette analyse fournira les proportions de cellules vivantes/mortes et intermédiaires, ce qui peut s’avérer utile pour la conduite d’une fermentation. La cytométrie en flux est une approche moderne dans la recherche de présence de levure dans le vin, elle se caractérise par sa rapidité d’obtention des résultats comparé aux méthodes de culture classiques. Cet outil analytique est donc extrême- ment utile pour orienter les prises de décision dans un cadre de production industrielle basée sur la fermentation et offre une réactivité inégalable aux acteurs du contrôle de qualité. Outre le domaine viticole, Sysmex propose des solutions adaptées à différents autres domaines, tels que la qualité de l’eau, la biologie végétale, l’industrie du papier, à retrouver en cliquant ici. Octobre 2022 - Sysmex Mag #7 3

Retour sommaire L’automation est au cœur des services de Sysmex France. Depuis plus de 20 ans Sysmex propose des solutions modulaires pour une gestion complète des paillasses d’hématologie cellulaire, d’hémostase et de cytologie urinaire. Ces solutions doivent intégrer vos laboratoires avec la plus grande efficacité, sou- vent sur la plus petite surface possible pour vous garantir votre excellence opérationnelle. Au sein de Sysmex France, trois consultants en au- tomation, issus de formation de biologie et certifiés en Lean Six Sigma management, ont la charge de définir la configuration la mieux adaptée aux besoins et contraintes des différents laboratoires. Chaque projet d’automation est pris en charge par l’un des consultants dont la mission d’accom- pagnement s’articule autour de trois axes principaux : Évaluation des besoins après l’analyse de la situation actuelle : Dans la routine quotidienne du laboratoire, il est généralement difficile de prendre le temps de comparer la capacité analytique de l’équipement actuel avec les besoins réels de prise en charge du patient et les projets d’évolution du laboratoire. Le renouvellement des automates est donc l’occasion de se pencher sur cette question. pris en compte durant l’analyse. Le rêve est autorisé à ce stade et est généralement associé à un réel be- soin de changement. Il est de notre responsabilité de synchroniser vos besoins avec les possibilités. Nous développerons des solutions en fonction de vos contraintes, de vos priorités et des options réalisables. sus de changement pour assurer la routine du laboratoire. Nous vous aiderons à gérer l’inévitable goulot d’étranglement pendant la phase de mise en œuvre du projet et nous vous assistons dans les réajuste- ments de la solution si nécessaire. Suivi de la performance : Après la mise en œuvre, un suivi continu est nécessaire pour s’as- surer que vos indicateurs de per- formances comme les temps de rendu de résultats correspondent à vos demandes initiales. Planning d’implémentation et ac- compagnement au changement : Valider ensemble une solution est bien sûr une étape importante ; mais nous vous accompagnons également tout au long du proces- Ne limitez pas vos exigences, les contraintes d’espace, de main- d’œuvre, … ou autres. Cela sera Interview Peux-tu te présenter en quelques mots et nous ra- conter ton parcours ? Après des études à l’école de laboratoire de La Pitié Salpêtrière à Paris, j’ai intégré divers laboratoires dans divers secteurs pour acquérir une expérience solide et pluridisciplinaire afin de pouvoir intégrer une société du diagnostic médical en ayant un bagage solide pour être crédible auprès des interlocuteurs et bien appréhender les besoins des laboratoires. Tout d’abord Ingénieur d’Application durant 11 ans chez Sysmex, en hématologie puis en hémostase, durant lesquelles j’ai pu acquérir de nombreuses compétences et qui m’ont permises d’accé- der aujourd’hui au poste de consultant en automation et d’exercer depuis quelques mois maintenant ce nouveau métier. Peux-tu nous dire ce que tu aimes dans ton métier ? Et plus particulièrement en tant que consultant en auto- mation chez Sysmex ? L’idée de trouver les meilleurs solutions techniques et organisationnelles pour un laboratoire pour des projets complexes, qui semblent au départ impossibles, est un défi très motivant ; il faut adapter, faire avec les contraintes, échanger avec les clients, pousser les limites, proposer… et arriver à une solution optimale qui répondra aux besoins. C’est un sentiment de satisfaction grisant. Un projet nécessite un échange constant entre toutes les équipes de Sysmex et les clients. C’est un point essentiel de notre métier, car nous avons besoin des connaissances et des compétences de tous les corps de métier pour l’aboutissement de celui-ci. Bref, il n’y a pas de rou- tine dans ce métier car chaque projet est différent du précédent, on apprend tout le temps, et c’est un vrai plaisir. As-tu une devise ? « À coeur vaillant, rien d’impossible ». C’est une devise que j’essaye d’ap- pliquer chaque jour. Valérie GOLLIOT, François DAUPRAT et Ludovic LECANTE Consultants en automation Octobre 2022 - Sysmex Mag #7 5

Retour sommaire Les travaux de modification ont été menés en limitant au maximum l’impact sur le quotidien du personnel du laboratoire, et sur le rendu des résultats. La formation de tous les techniciens a été assurée durant la période de travaux. Pour cela, les CN-6000 ont été installés en mode « stand alone » dans une pièce séparée de l’activité quotidienne. L’Ingénieur d’Application, dédié à l’hémostase et au site a pu former les différents techniciens intervenant en hémostase et a accompagné les techniciens référents aux différentes vérifications de méthodes obligatoires. À la fin des travaux, l’installation du CN-Track avec les différents convoyeurs est réalisée (visionner la vidéo) et les automates sont définitivement reliés à celui-ci pour créer l’ilot d’hémostase ou CN-Track. La formation du personnel à l’utilisation du CN-Track avec une révision des « acquis » est mise en place et pour ce faire des dossiers tests sont lancés très régulièrement avec des tests dits « grandeur nature » afin que tous les aspects de la mise en production soient pris en compte (gestion de la répartition des analyses sur les automates, du flux des tubes, ges- tion des CQ, des urgences, validation des dossiers, etc…). En parallèle, un travail très important a aussi été mené pour mettre en place toutes les interfaces informatiques avec le paramétrage du middleware, des réanalyses et/ou re-dilutions, des règles de déclenchement des analyses complémentaires, la gestion des alarmes et autres informations liées aux résultats des analyses. Le jour « J », mi-avril, la mise en routine s’est dé- roulée en début d’après-midi, après un redémarrage du middleware. Aucun retard dans le rendu des résultats des pa- tients n’a été constaté, ni de blocage ou de scénario catastrophe, levant ainsi les questionnements ou parfois les angoisses dissimulées de certains sur la capacité à gérer une nouvelle organisation et la mise en place de nouveaux automates. La prise de conscience d’un besoin de changement des habitudes, d’adopter de nouveaux réflexes et l’acceptation par tous de travailler selon la même méthode a permis la réussite de ce démarrage en production. Le succès de cette opération est associé à une intervention conjointe et coordonnée de toutes les équipes du CHU de Montpellier, des interve- nants externes et de toute l’équipe de Sysmex France. Octobre 2022 - Sysmex Mag #7 7

Retour sommaire La biopsie liquide, une nouvelle opportunité pour l’oncologie personnalisée 1/ Qu’est-ce que la biopsie liquide ? Pourquoi l’utiliser ? Une biopsie liquide correspond à un prélèvement sanguin non invasif qui a pour but d’identifier l’ADN tumoral circulant (ADNtc) provenant de cellules cancéreuses dans le sang. 3/ Qu’est-ce que Plasma Seq Sensei ? Les kits Plasma-SeqSensei™(PSS) offrent des tests basés sur la technologie de séquençage de nouvelle génération (NGS) permettant une détection haute- ment sensible et quantitative des mutations dans l’ADN tumoral circulant du plasma. Contrairement à la biopsie tissulaire reconnue comme le gold standard, une biopsie liquide est non invasive, accessible facilement, à tout moment et permet d’avoir un visu sur l’hétérogénéité tumorale. Notre solution PSS vous fournit des résultats en deux jours, en générant des rapports faciles à lire à l’aide du logiciel Plasma-SeqSensei™ inclus dans la solution. Une biopsie liquide peut être utilisée pour diagnos- tiquer un cancer à un stade précoce, ainsi que pour aider à planifier le traitement, pour savoir s’il est efficace ou si une récidive est survenue. La prise de plusieurs échantillons de sang au fil du temps peut également aider les médecins à comprendre quels types de changements moléculaires se produisent dans une tumeur et comment cela peut influencer le traitement. 2/ Qu’est-ce que l’ADN tumoral circulant ? L’ADN circulant est défini comme un fragment d’ADN qui circule librement dans le sang. En effet, au cours de processus de dégradation cellulaire, nos cellules relarguent de l’ADN. Il peut s’agir d’ADN sain ou bien d’ADN de cellules tumorales. Cet ADN tumoral circulant peut être analysé pour rechercher des altérations moléculaires par exemple par NGS. Retour sur notre lancement des kits disponibles en version RUO et IVD Nos kits PSS sont disponibles pour les cancers du sein, du poumon, du colon, de la thyroïde et pour le mélanome. 4/ Pourquoi rechercher ces mutations ? Les méthodes se sont développées pour déceler des mutations somatiques. Ainsi pour le cancer du côlon, plus de 30 mutations peuvent être recherchées. Selon le type de cancer (colorectaux, des poumons non à petites cellules, gastro-intestinaux, etc.) la recherche des mutations de EGFR, KRAS, NRAS, BRAF, KIT, PDGA a été effectuée pour permettre des ciblages thérapeutiques spécifiques. Il est admis que la quantification d’ADNtc et son génotypage, reflétant l’importance de la tumeur et indiquant ses mutations somatiques, peuvent ainsi représenter un marqueur dont l’intérêt pratique est multiple concernant le dépistage, le diagnostic initial, l’évaluation de l’efficacité thérapeutique, la récidive, l’évaluation précoce de la progression tumorale et la détermination des clones de résistances. De plus, la mesure ADNtc va refléter l’état génétique de toutes les cellules de la tumeur, alors que la biopsie tissulaire ne va analyser qu’une section fine de celle-ci. Nos tests Plasma-SeqSensei™ permettent une dé- tection ultra-sensible (0.06–0.07%) et quantitative des mutations dans l’ADN tumoral circulant du plasma, aidant ainsi les oncologues à adapter précisément le traitement à chaque patient. Octobre 2022 - Sysmex Mag #7 9

Retour sommaire Retour Medical Run L’association CAMI Sport et Santé organise la Medical Run depuis 2017. Cette course réunit l’ensemble des personnes du secteur médical : médecins, phar- maciens, kinésithérapeutes, ostéopathes, collaborateurs de l’industrie médicale, métiers du paramédical ainsi que des étudiants en santé, pour soutenir la CAMI. La CAMI est la première association qui allie des programmes d’activités sportives thérapeutiques, dédiés aux traitements en cancérologie et en hématologie. Leur mission est d’accompagner 3 500 patients par semaine grâce à l’expertise d’une trentaine de Praticiens en Thérapie Sportive, sur environ 80 lieux de soins en ville et l’hôpital dans 29 départements en France. Sysmex France, partenaire depuis 2018, soutient cette année encore l’association en offrant la possibilité à ses collaborateurs de participer à cette course. Cette organisation propose depuis 2020 un challenge digital qui complète le format présentiel. Sysmex France remercie ses collaborateurs pour leur participation à cette course solidaire, pour le bé- néfice d’une grande cause. LA CAMI LA MEDICAL RUN < Pour plus de renseignements, consultez les sites suivants Octobre 2022 - Sysmex Mag #7 11